技術(shù)文章
導(dǎo)讀:為了刺激研究界實現(xiàn)更高標(biāo)準(zhǔn)的抗體重復(fù)性,抗體驗證工作組(IWGAV)近日出臺了一套指南。這些指南發(fā)表在9月5日的《Nature Methods》雜志上,強調(diào)了抗體驗證需要針對應(yīng)用和背景來開展。
據(jù)估計,因抗體質(zhì)量不佳,生命科學(xué)領(lǐng)域每年的損失達到8億美元。同時,這也造成了無數(shù)的實驗失敗,浪費了寶貴的樣本和科學(xué)家的青春。盡管科學(xué)界已經(jīng)意識到這個問題,但目前仍然缺乏抗體驗證的整體框架。
為了刺激研究界實現(xiàn)更高標(biāo)準(zhǔn)的抗體重復(fù)性,抗體驗證工作組(IWGAV)近日出臺了一套指南。這些指南發(fā)表在9月5日的《Nature Methods》雜志上,強調(diào)了抗體驗證需要針對應(yīng)用和背景來開展。
這篇題為“A Proposal for Validation of Antibodies”的文章是由IWGAV的數(shù)名成員發(fā)表的,包括工作組主席、瑞典*理工學(xué)院的微生物學(xué)教授Mathias Uhlén。文章提出了五點,以指導(dǎo)特定應(yīng)用中的抗體驗證。
• 遺傳策略:測定對照細胞或組織中的相關(guān)信號,這些對照中的目標(biāo)基因已利用CRISPR或RNAi等技術(shù)敲除或敲低。
• 正交策略:利用不依賴抗體的方法定量多個樣品,然后檢查依賴抗體和不依賴抗體這兩種定量之間的相關(guān)性。
• 獨立抗體策略:利用兩個或更多的獨立抗體來識別目標(biāo)蛋白上的不同表位,再通過比較和定量分析來確認特異性。
• 表達標(biāo)記蛋白:修飾內(nèi)源的目標(biāo)基因,增加親和標(biāo)簽或熒光蛋白的序列。標(biāo)記蛋白的信號可與基于抗體的檢測相關(guān)聯(lián)。
• 免疫捕獲加上質(zhì)譜分析:將免疫捕獲與MS分析相結(jié)合,以確定與純化的抗體直接作用的蛋白質(zhì),以及可能與目標(biāo)蛋白形成復(fù)合物的蛋白質(zhì)。
這篇文章還對生產(chǎn)商和使用者提出建議,以確保長期的抗體重復(fù)性。作者們建議使用者在自己特定的應(yīng)用或樣品中,至少運用上面的一種策略來開展驗證。同時,他們還建議使用者按照一定的形式報告,包含貨號、批號和RRID(研究資源標(biāo)識符),以確保研究中使用的任何抗體可被明確識別。
同時,作者們也向生產(chǎn)商提出了類似的建議,至少運用一種策略來驗證,并提供盡可能多的抗體信息,如鑒定檢測中的抗體濃度、細胞提取物的濃度、抗體生產(chǎn)所用的免疫原、抗體-表位的親和力、緩沖液配方等。
“這篇文章邁出了重要的*步,有望制定出廣泛接受的抗體驗證標(biāo)準(zhǔn),確保生命醫(yī)學(xué)研究使用高質(zhì)量且一致的抗體,”Uhlén博士表示。“我們期待抗體用戶、出版商、資助機構(gòu)和生產(chǎn)商的反饋,以幫助加強這個初步建議,并確保這些基本工具的可靠性。”
在文章發(fā)布之后,抗體生產(chǎn)商之一 – 賽默飛世爾公司承諾,它將按照IWGAV的建議來驗證其抗體的特異性。賽默飛表示,它將很好地遵循這個指南,并借助其的質(zhì)譜、CRISPR和siRNA平臺來開展驗證。此外,對于通過新標(biāo)準(zhǔn)的抗體,公司會在上標(biāo)注,以表示它通過特異性檢測。
賽默飛世爾的生命科學(xué)部門總裁Peter Silvester表示:“賽默飛世爾很高興看到抗體驗證工作組的*個建議。我們相信,這些標(biāo)準(zhǔn)將有助于對抗用戶在使用這些關(guān)鍵工具時面臨的挑戰(zhàn)。我們承諾按照IWGAV的標(biāo)準(zhǔn)來測試我們的抗體,這證明了我們對科學(xué)的承諾,以及我們提供特異抗體的使命。”
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